Bâti dans la vallée de la Dheune à une dizaine de kilomètres de Chagny, St Gilles faisait autrefois partie de Dennevy, et dépendait de la Seigneurie de Chamilly, érigée en comté en faveur de Noël-Bouton, maréchal de Louis XIV. (devint « commune » en 1862).

De vieilles maisons datent du début du XVIIème. L’église, aménagée en 1864, comporte une immense cave, actuellement transformée en salle des Fêtes . Un château, construit vers 1870, domine le village de St Gilles (à voir : 3 lavoirs, une stèle gallo-romaine). Tandis que la Dheune serpente dans les prairies, le Canal du Centre, lui , longe la départementale 974, nombreux sentiers de randonnée, empruntant les chemins dans les vignes, ou la Voie Verte.